胆囊炎的抗生素应用要根据造成胆囊炎的细菌的菌谱来选择，常见菌有革兰氏阴性菌、厌氧菌等，具体如下：
1、革兰氏阴性菌：通常情况下，比较常见的引起胆囊炎的细菌是革兰氏阴性菌，比如大肠杆菌、链球菌等，还有克雷伯氏肺炎球菌等引起胆囊炎。对革兰氏阴性菌比较敏感的药物一般情况下有头孢类，如头孢二代、三代抗生素。
2、厌氧菌：胆囊炎一般都合并有厌氧菌的感染，所以还要加上对厌氧菌敏感的药物，比如甲硝唑、替硝唑、奥硝唑等抗生素。临床上对抗生素的选择，首先是经验治疗，比如病人开始发烧、疼痛、高热，这样的情况一般先选择头孢类加上奥硝唑或者是甲硝唑、替硝唑等进行治疗。
如果是要进一步的来确定细菌谱，可以通过血液培养或胆汁培养，最后看对哪一种抗生素比较敏感，就是平常说的药敏试验来确定抗生素，这是最准确。但一般情况下，一般细菌都对头孢类和硝唑类抗生素比较敏感，所以临床上用的比较多就是这类抗生素。