现在的临床上肛瘘可以分为低位肛瘘和高位肛瘘，如果是低位的肛瘘，需要进行单纯的切开，但多数情况下，经过七天严重的炎症渗出期一般就不会疼，但是有一些病人会出现炎症加重的情况，有可能疼痛的时间会变得长些，疼痛也有可能会进一步的加重。
如果是高位的肛瘘，需要采用不同的手术方法进行治疗，如果是采用挂线疗法，会疼痛5-12天，之后症状就会有所减轻。
但是以前也有病人会因为身体素质的不同，疼痛的时间会有所延长或者是缩短，如果病人疼痛的时间有些长，病人就需要及时去医院进行处理，可以选择进行复诊检查及治疗。