腘窝囊肿不能热敷，对于腘窝囊肿的治疗，热敷是没有用处的。腘窝囊肿形成原因多数都是由于膝关节的后方关节囊上有裂孔，关节液经裂孔渗透到腘窝部，形成一个囊性的肿物，这个肿物一般随着活动量的增多会有增大，多休息之后肿物会有一定的缩小。囊肿与关节腔是相通的，但是实际上关节液进入囊肿比较容易，从囊肿回流到关节腔比较困难，因此在膝关节外形成囊肿。
在治疗上，没有任何症状的腘窝囊肿可以观察，不需要特别的治疗。如果引起局部不适的需要治疗，治疗包括手术切除，从后方腘窝表面切开，将囊肿找到之后彻底切除，同时修复后方的关节囊，避免以后出现复发。另一种方式是比较微创的，在关节腔内将关节腔与囊肿之间的关节囊打开，形成一个内引流，这样关节滑膜内的囊肿就可以顺利回到关节腔内，囊肿就消失了。