总体的说，CT和核磁共振的检查原理不同，核磁共振检查以神经系统为主，而CT以头部筛查以及肺部扫描为主。以头部为例，CT和核磁共振都可以进行检查，但各有利弊。CT对于脑出血显示清楚，而且急诊必须要做头部CT，看是否出血，以免贻误病情。对于小的梗塞核磁共振检查显示更清楚。如果经常头晕的话，考虑脑供血不足，可以做核磁共振。可以显示CT无法显示的小病灶。核磁共振检查，对新发梗塞可以发现六个小时之内的梗塞，也就是核磁共振脑功能成像中的DWI。为临床提供时间依据，而CT24h后才能显影，会失去溶栓的时间窗。所以在新发梗塞的检查中，核磁共振检查更有优势。CT和核磁共振两项检查。有时必须都要做，有时可以选择其中一个。所以咨询医生看适合哪项检查方法。