对于轻微脑血栓的患者，首先需要行头颅核磁共振检查，确保颅内没有特殊病变，通常情况下需要用他汀类药物进行治疗，并且需要使用预防血小板聚集类的药物，抗血小板聚集药物常用的有阿司匹林和氯吡格雷，同时要给予神经保护治疗，常用的药物主要有依达拉奉、胞磷胆碱和脑蛋白水解物。
还可以给予改善血液循环的治疗，主要的药物有舒血宁、疏血通、维脑路通以及川芎嗪等。同时应控制危险因素，比如高血压的患者口服降压药物，临床应用左旋氨氯地平、苯磺酸氨氯地平片、厄贝沙坦等。如果有糖尿病史的患者，一般需要口服降糖药物，维持血糖于正常水平，临床常用的降糖药物有二甲双胍、瑞格列奈，以及拜糖平等等。