小脑萎缩主要是针对不同病因进行相应治疗，如慢性酒精中毒引起小脑萎缩，应该让患者戒酒，同时给予大量B族维生素治疗。
遗传性小脑萎缩，像多系统萎缩或脊髓小脑性共济失调所导致小脑萎缩，目前尚无特效治疗，多以对症治疗为主，可以给予营养脑细胞药物，如胞二磷胆碱、艾地苯醌、丁苯酞等药治疗，可以有一定作用，但通常不能治愈。因此，目前小脑萎缩还是采用对症治疗为主。