亚临床甲状腺功能减退症主要依靠实验室检查结果进行诊断，所以首先要排除其他原因引起的血清TSH增高，主要有以下六个方面：
第一、TSH测定干扰，被检者存在抗TSH自身抗体，这就可以引起血清TSH水平假性增高。
第二、低T3综合征恢复期，血清TSH可以升高。
第三、20%的中枢性甲状腺功能减退症患者表现为轻度的TSH增高。
第四、肾功能不全，10.5%的终末期肾病患者有TSH增高，可能与TSH清除减慢以及碘排泄减少有关。
第五、糖皮质激素缺乏也会引起轻度的TSH增高。
第六、生理适应，长时间暴露于寒冷环境可以使血清TSH浓度升高30%-50%。