胆囊炎抗生素的选择主要是根据致病菌不同而选择，急性的胆囊炎大多数是大肠埃希杆菌，是一种革兰氏阴性菌，胆囊炎也常常合并厌氧菌感染。
所以临床上常常使用头孢哌酮-舒巴坦以及甲硝唑联合抗感染治疗，通过抗生素的治疗可以抑制细菌的感染，使炎症减轻，可以达到更好缓解症状的目的。
如果通过抗生素抗感染治疗后症状没有明显的恢复，病情进一步的发展，需要选择更高级的抗生素抗感染治疗，如果发生胆囊穿孔，甚至需要手术才能达到治疗的目的。