强直性脊柱炎的并发症比较多，主要是因为后期随疾病病情的发展，侵犯全身组织导致。大概25%的病人会出现虹膜炎。部分病人出现肺部问题，如肺尖纤维化、囊性变，甚至肺部有空洞形成。因为强直性脊柱炎压迫神经，从而导致相关症状的产生，严重的患者可能会出现瘫痪。少部分病人会出现肾脏疾病和心脏疾病，以及出现前列腺炎等疾病。