双侧上颌窦炎，治疗的目的主要是通畅鼻腔、鼻窦的引流，根除病因，避免反复发作。同时应该积极抗感染，预防并发症。对于急性双侧上颌窦炎，主要采取药物治疗，如果保守治疗无效可以考虑手术治疗。
急性期可以脓培养加药敏，进行针对性的抗生素治疗，常见的抗生素有阿莫西林、头孢二代。局部鼻腔可以用减充血剂治疗，注意减充血剂不能连续使用超过7天，常见药物有盐酸萘甲唑啉、麻黄碱滴鼻液。
抗组胺药也可以治疗上颌窦炎，抗组胺药可以减轻变态反应，改善鼻部过敏症状，常用的有氯雷他定、西替利嗪，鼻腔可以进行海盐水或生理盐水冲洗。上颌窦穿刺冲洗也是一种治疗办法。