新生儿呕吐的原因分为生理性的或病理性的，生理性就是喂养不当，这是引起新生儿呕吐的常见原因。尤其是宝宝刚生下来，消化功能很不完善。如果喂养不当、喂养的次数过于频繁，或者一次喂奶量过多、喂奶的温度不合适、奶嘴过大或过小，还有产妇的乳头下陷，都可以造成宝宝喂奶后出现呕吐的情况。再有宝宝喂奶的时候哭闹，咽下过多的气体，也可以在喂奶后出现呕吐。另外，喂奶后如果频繁更换孩子的体位，也容易造成孩子呕吐，这是生理性原因。
病理性原因常见的是胃食管反流、贲门失弛缓症、幽门痉挛、胎粪性便秘、咽下综合征，还有急性肠炎、坏死性小肠炎、食道裂孔疝、肥厚性幽门狭窄、肠黏膜梗阻、肠狭窄、肠闭锁、先天性巨结肠等。另外，还有其他常见的感染性疾病，如败血症、肺炎，也可以造成新生儿呕吐。