唇腭裂的形成是在胚胎发育期，头面部有很多的突起，突起融合以后形成整个的面部。在突起融合的过程当中，如果受到了环境的刺激，或者在遗传因素的作用下，没有发生融合或者发生部分融合，就会形成唇腭裂。面部有很多的突起，形成唇部的突起是上颌突和球状突，如果上颌突和球状突完全没有融合，就会形成完全性的唇裂。如果是部分融合就会形成不完全的唇裂，形成腭部的是前腭突和侧腭突；如果前腭突和侧腭突之间没有融合，就会形成完全性的腭裂；如果前腭突和侧腭突融合了，侧腭突和侧腭突之间没有融合或者没有完全融合，就会形成不完全性的腭裂或者形成软腭裂。