肾结核需要进行抗结核治疗，对于肾脏破坏不很严重者，通过抗痨治疗6-9个月进行观察即可。而对于肾脏破坏严重的肾结核患者，需要抗痨治疗2-3周，进行手术治疗。对于肾结核所使用的抗痨药包括雷米封、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇，个别患者由于肾结核合并明显的感染，可以使用左氧氟沙星。
在使用抗结核药的过程中，要定期检查肝脏功能和肾脏功能，尤其是使用利福平后，会出现肉眼血尿，而使用吡嗪酰胺后会导致血尿酸的明显增高，需要了解药物的副作用，并进行相应的处理。