肿瘤标志物是存在于血液、尿液和唾液中反映肿瘤的化学物质，提示肿瘤发生和来源，判断肿瘤手术治疗预后情况，预测肿瘤放化疗效果，具有特异性、敏感性强的特点。膀胱肿瘤标志物不是太多，特异性和敏感性都不是特别高。尿液中主要有NMP22，膀胱肿瘤抗原BTA，血液中正在研究的有血清miRNA-100，miRNA-143。研究发现尿路上皮癌中的血清尿液中mi-RNA100和mi-RA143表达含量明显高于良性疾病组，其可能对预测膀胱肿瘤的发生、发展及转移有一定指导意义。因为膀胱肿瘤标志物仍不成熟，未应用到临床，临床仍以超声、CT和膀胱镜作为主要检查手段。