IgA肾病的患者由于临床表现形式及病理损害程度的不同，预后差异非常大。总的统计学发现IgA肾病10年的存活率可以达到80%，20年存活率达到60%，影响IgA肾病预后的主要因素是年龄、高血压、低蛋白血症和高尿酸血症等。
通常情况下，对于高龄患者预后相对较差，可能经过5-10年就进入慢性肾功能衰竭即尿毒症期，需要进行肾脏替代治疗。对于IgA肾病的患者，尤其是在Ⅲ-Ⅳ级且常常合并有高血压及肾功能的减退等，预后相对较差，会在5-10年的时间进入慢性肾功能衰竭即尿毒症。