造成儿童情绪障碍的原因较多，其中遗传因素是一个原因，幼儿时期胆怯、敏感或过分依赖者易产生情绪障碍。家庭因素和不良的教育方式、对小孩过度保护或过分严格苛求、态度粗暴等都可能使儿童发生情绪障碍。若儿童幼年时期遭受精神创伤，深刻的情感体验也是常见致病因素。躯体疾病或过度紧张疲劳、学习负担过重对发病均具有影响。
一、主要病因
1、分离性焦虑障碍病因：多发于对紧张性刺激反应过强或过分敏感的儿童，如果这种反应已成为习惯性倾向时，称为“焦虑素质”。此与遗传有关，持续的紧张环境可使儿童发病，另有一些病儿与父母慢性焦虑有关或因过分依赖成人所致。
2、儿童恐怖性障碍：正常儿童在成长发育过程中都可能会对一些特殊的物体或情境出现恐惧害怕的现象，这是面临危险处境的一种防御反应，不属于病态症状。害怕的物体与情境包括与父母分离、黑暗、动物、登高、雷电、学校等。
3、社交敏感性障碍：儿童对新环境或陌生人产生恐惧、焦虑情绪和回避行为，主要与周围的环境和人有关系。可能因为不愿到陌生环境，害怕与母亲分离等有关。
4、儿童强迫症：儿童强迫症是强迫症的一类，是一种明知不必要，但又无法摆脱，反复呈现的观念、情绪或行为。在儿童期，强迫行为多于强迫观念，年龄越小这种倾向越明显。
5、儿童癔症：家庭不和、教育方法不当、父母对孩子过分溺爱和保护都易使儿童发生癔症。文化程度及家庭经济水平低、或地方风俗迷信影响的儿童也易发生癔症。
6、儿童抑郁症：本症多发生于少年期，病因尚未清楚，可能是多因素所致，包括遗传因素、生化代谢缺陷和环境因素等。
二、诱发因素
1、家庭因素：如父母离异、家庭环境不和谐、单亲抚养为主、父母外出务工、留守儿童、隔代抚养等，这种情况容易出现情绪障碍。
2、学习压力比较大：有些儿童性格比较内向，学习压力相对比较重，学习成绩不好，从而引起压力增大，出现情绪障碍。