膀胱结石的治疗，通常包括较小的结石，如小于0.6cm的结石，通常可以自行排出体外。
大多数的膀胱结石需要进行外科治疗，包括体外冲击波碎石来进行治疗，或者采用腔内的治疗手段，如经尿道器械碎石、大力碎石钳，或者经尿道液电碎石、经尿道超声碎石、经尿道气压弹道碎石，或者经尿道激光碎石术，一些较大的结石同时会合并前列腺增生。膀胱肿瘤等患者也可以考虑行膀胱切开取石，同时处理并发病变，通常需要在专业医生指导下选择合理的手术方案。