上颌骨囊肿手术后遗症：第一、面部形态的改变，因为颌骨是支撑中部的面部形态，切除了比较大的囊肿以后，还要切除掉一部分的骨组织，避免囊肿的复发，就会导致面部有一定的凹陷，可以通过后期修复的方式来恢复面型，但是可能与原来的面型还是存在一定的区别；第二、因为上颌骨距离颅内较近，很容易引起脑神经损伤，引起患者出现面瘫或者其他脑神经症状；第三、就是囊肿的复发，因为囊肿是会像手指一样深入到骨组织里面，所以在切除的过程中，很有可能导致囊肿切除不完全，最终导致囊肿复发。