儿童甲型流感主要是由于甲型流感病毒所引起的，流感发病的严重程度与个体免疫有关，仅有50%的感染儿童会发展成典型流感。流感典型的症状为突然发热、头晕、头痛、肌痛，全身症状比较重。同时伴有喉咙痛和咳嗽、鼻塞、流涕、胸痛、畏光等症状，体温可高达39-40℃，持续2-3天后渐退，全身症状比较重而呼吸道感染并不严重。最严重的并发症是肺炎，以继发性细菌性肺炎为常见，金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌和嗜血杆菌感染为多见。其还有其他的并发症，比如中毒性休克、心肌炎、中毒性肠炎等。