子宫内膜异位症自己好了还可能会复发，异位的子宫内膜会随月经周期性变化出现周期性出血。子宫内膜异位症盆腔疼痛的程度与疾病的严重程度不相关，继发性痛经及性交痛为常见的盆腔疼痛表现。痛经可发生在经前、月经期或经后。如果侵犯子宫直肠窝可发生深部性交痛；病灶刺激膀胱及结肠，在经期可有便血和疼痛；腹部切口子宫内膜异位症疤痕结节在经期增大，疼痛加重。