正常的智齿在不发炎的时候不引起头疼，上颌的智齿在发炎的时候也不引起头疼，只有下颌的智齿在出现牙髓炎、智齿冠周炎，或者引起第七牙远中出现龋坏，造成牙髓炎以后才有可能引起头疼。
因为下颌神经除了分支出下牙槽神经以外，还有一支分布到颞部，所以下颌牙齿出现疼痛以后有可能会反射到耳颞部，从而引起头疼。
所以可以检查阻生的智齿，如果周围的牙龈发炎了可以进行冠周的盲袋冲洗，控制炎症以后疼痛就会消退。
如果智齿出现了持续性疼痛且在夜间加重，触碰的时候没有明显的疼痛，这是牙髓炎，可以尽早将其拔除。如果智齿本身的牙冠完整，而引起了第七牙远中龋坏造成第七牙的牙髓炎，尽早进行开髓引流就可以控制疼痛。