子宫囊肿分为宫颈囊肿和子宫体囊肿，宫颈囊肿比较小时，多没有临床症状，如果囊肿比较大，患者可以出现小腹坠胀不适、腰酸等不适，所以宫颈囊肿比较小时不需要进行处理。宫颈囊肿比较大时，可以选择冷刀切开引流或者选择自凝刀、微波等进行治疗。
子宫体囊肿最常见于子宫内膜异位症，这种情况下患者会伴有痛经进行性加重，同时患者可以出现非经期的小腹疼痛，同房时小腹疼痛，以及患者会出现月经量增多、月经经期延长、阴道不规则流血、继发性不孕等一系列的临床症状，子宫肌瘤水肿变性或者囊性变也会表现为囊肿形态。此外，还可以见于黏液性的囊肿，这种情况原因不明，患者都没有明显的临床不适，主要通过彩超检查发现。