甲状腺囊肿由甲状腺结节囊性变而来，其内为浅黄色透明的囊液，一般很安全，但有少数可以发生囊内出血，还有更少见的囊内感染。
前者因为囊肿壁的血管破裂出血而致，多有诱因，如咳嗽等震动或者挤压，表现为迅速增大，伴有疼痛，甚至发低烧。后者表现为囊肿增大较平时快，且多伴发烧，触之会痛，常伴颈侧区淋巴结肿大及疼痛。