肛周脓肿引流手术之后不一定形成肛瘘。肛周脓肿和肛瘘的形成原理大部分一样，主要都是在肛窦炎的基础上继发形成的。肛窦发生炎症，主要受大肠杆菌感染，感染之后就会导致肛门周围的皮下组织出现炎症，出现团块以及有可能形成脓肿。部分病人通过脓肿切开引流手术，治愈好了以后，肛窦处的内口，潜在的内口会自行愈合，这种情况就不会形成肛瘘。
但是有一部分病人，脓肿切开引流表面好了以后，但是内口没有愈合，这种情况可能形成肛瘘。总体的发生率不好说，在临床工作中发生率比较低。大部分肛瘘都生在肛周脓肿自行破溃，没有到医院进行换药和处理的基础上发生。如果肛周脓肿在医院行切开引流，并且积极换药，大部分都可以愈合。