附睾炎的治疗当中主要是生活方面的处理，早期可用冰袋冷敷，到后期可热敷或者热水坐浴，但是需要告知患者热敷或者热水坐浴，可能会影响到睾丸的生精功能，对于未生育者应当慎重使用。
其他的生活治疗还包括注意休息，托起阴囊可减轻疼痛症状，附睾炎核心的治疗是抗生素的使用，经验性推荐头孢类抗生素静脉点滴加大环内酯类或喹诺酮类的抗生素口服，以后可以根据培养结果选择敏感抗生素，通常是静脉给药1-2周后，再口服抗生素2-4周，其他药物可选择口服的镇痛药物、非甾体类的抗炎药物、中药治疗，必要的时候需要行手术治疗。