足背是腱鞘囊肿较为常见的发生部位，如果囊肿较小、不影响患者生活和工作时无需特殊处理。如果囊肿较大且伴有轻度的胀痛，影响患者行走的情况下可以行保守治疗。
保守治疗的方法包括注射器抽吸囊液，并给予皮质激素注射，部分患者可以获得彻底的治愈，也有相当部分的患者会再次发作。
也可以采用挤压的方法将囊壁挤破后加压包扎，但这种方法处理简单、复发率较高。彻底的治疗方法需采用手术治疗，在连硬外麻醉后将囊肿完整的显露，将蒂部和周围部分腱鞘组织以及滑膜组织予以切除，可有效的降低足背部位腱鞘囊肿的复发率。