对于比较小而又没有症状的囊肿，可以不用治疗，需要注意复查。对于比较大的囊肿或已经出现感染、梗阻、压迫症状的囊肿，要考虑手术治疗，手术方案需要结合囊肿的大小和具体部位。对于比较表浅的囊肿，可以考虑通过肛管进行穿刺治疗，多需要反复抽吸囊液从而封闭囊肿。比较大的囊肿或已经出现感染的囊肿，需要做切开引流手术，目前最常用的手术方案是经尿道电切除囊肿，年轻的患者一定要慎重操作，保留精阜保证年轻患者的射精功能。日常要注意个人卫生、确保大便通畅、保持心情愉悦、饮食清淡、避免辛辣食物刺激、久坐等，可以降低发病情况。