鼻窦炎一般可分为急性鼻窦炎和慢性鼻窦炎，能否做鼻咽拭子要分情况而定，具体分析如下：
1、可以做：部分慢性鼻窦炎一般没有任何不适症状，只是在检查中才发现，比如通过影像学拍片可以看出有鼻窦黏膜的增厚。当然，如果没有任何不适症状的情况，鼻咽拭子可以做。
2、不能做：鼻窦炎急性发作期一般会出现鼻腔黏膜的充血、肿胀、脓性分泌物增多，或者是出现头疼等症状，此时鼻咽拭子就尽量不要做，可能会导致取标本失败。另外，也可能会引发鼻部剧烈的疼痛感。所以，对于急性鼻窦炎，还需要选择敏感的抗生素积极控制炎症。