目前临床上还没有对室间隔缺损病人的平均寿命进行调查、研究或者有明确的数字，室间隔缺损的程度不同，预后也不一样。对于非常小型的缺损，在超声上可以看到左向右的分流，但是分流量很少。
而且没有带来房室结构的变化，不需要特殊处理，只需要定期复查，寿命基本不受影响。部分室间隔缺损，如果能在儿童或者青年时期进行相应的治疗，比如介入的方法或者外科手术的方法，对室间隔缺损进行封堵或者修补。
把缺损完全堵住就可以阻止房室结构的变化，预后与正常人是无异的。但是部分室间隔缺损的病人已经丧失手术的机会，已经造成非常严重的左、右心室结构的变化，肺动脉的压力比较高。
这部分的病人预后非常不好，后期会出现反复的心衰，也没有生活质量，但寿命是多少没有研究报道。