先天性的唇腭裂可以遗传，但是目前医学界认为，先天性唇腭裂是遗传因素和环境因素共同作用的结果，不单纯是遗传引起来的。
但是在临床上，经常可以看到父母有先天性的唇裂或者腭裂，孩子就会很容易得唇腭裂，也就是孩子得唇腭裂的几率要明显的增高，是正常人群的十几倍。
另外，先天性的唇腭裂还和环境因素有关，比如说在母亲妊娠期吸烟或者是经常吸二手烟，也就是被动吸烟，或者是在妊娠早期饮酒，接触有害物质，或者是由于皮肤疾病应用了一些药物。
这些都可以影响胎儿的正常发育，影响颌面部各种突起的融合，就会引起先天性的唇腭裂。