阴道纵隔是双侧副中肾管会合以后，尾端纵隔未消失，或者部分消失导致，分为完全纵隔和不全纵隔。完全纵隔以对称性为特点，阴道纵隔通常会伴有双子宫、双宫颈和双侧的肾脏发育不良。阴道完全纵隔的患者通常没有明显的症状，对性生活和阴道分娩没有明显的影响。不全纵隔可能会有性生活困难或者不适，分娩时胎先露部下降受阻，而发现阴道纵隔。
进行妇科检查时，阴道内可见纵行的黏膜壁，分为两条纵行的通道，黏膜壁上端接近宫颈。完全纵隔下端达到阴道口，不全纵隔未达到阴道口，阴道完全纵隔通常会合并有双子宫。阴道纵隔影响性生活和阴道分娩时，应该行纵隔切除手术，缝合创面以防止再次粘连，如果在分娩的过程中，发现阴道纵隔，可以当先露部下降压迫纵膈时，切断纵隔中部，等待胎儿娩出以后再切除纵隔。