对于先天性胆道闭锁的病因，目前并未完全明确，据研究有可能和以下几种因素有关：
1、感染：胆道闭锁的发生与胎儿在宫腔内发生病毒感染有关，临床上比较常见的有巨细胞病毒、轮状病毒等。
2、发育因素：当肝脏内外胆管未能正常发育时，会发生胆道闭锁。
3、梗阻：肝内肝小管出现炎症感染继发梗阻，导致先天性胆道闭锁的发生。
4、基因突变：也是导致胆管闭锁的因素之一。