如果按医生指导的剂量服用甲钴胺，是极少出现副作用的。甲钴胺最常见的副作用就是胃肠道反应，包括但不限于饮食不振、恶心、呕吐、腹泻、消化不良等，也有一些患者服用甲钴胺之后出现过敏反应，皮肤出现皮疹，但抗过敏治疗后很快好转，并没有严重过敏反应的报道。如果超大剂量、或者没有医师指导长时间服用甲钴胺的话，可能会出现神经失常。