1、病原学检查：采用血膜染色镜检法，在患者外周血中检出疟原虫是疟疾确诊的金标准。
2、循环抗原检测：利用血清学方法检测疟原虫抗原，快速试剂盒可在2~15分钟得到结果。
3、循环抗体检测：迄今为止所有实际应用疟疾血清学试验仍是基于疟原虫无性期抗体的检测。疟原虫抗体在感染后2~3周出现，4~8周达高峰。
4、分子生物学检测：采用PCR技术可检测外周血中的疟原虫抗原基因片段
5、核酸探针检测：具有独特的高特异性，敏感性可高于镜检，可在短时间内成批处理大量样本，已被认为可以定量及估算疟原虫血症水平，是疟疾流行病学调查及评价抗疟措施效果很有潜力的诊断工具。