磁共振与CT，同属于高端的影像学诊断设备，而在诊断的范围方面，二者诊断的相互覆盖面比较广。但是在某些方面，还是各具优势，例如CT对于胸部病变、一些出血性疾病以及头颅、胸腹、脊柱、骨盆等骨骼方面的诊断，都具有一定的优势。而磁共振特别对于内脏软组织的一些检查，具有绝对优势，例如对于肝癌、肺癌、胰腺癌等恶性肿瘤的诊断。如果采用加强磁共振，可做出定性诊断，其诊断率接近组织病理穿刺活检的诊断。