扁桃体发炎发烧后咳嗽，考虑可能是炎症累及到支气管，所以咳嗽比较严重的情况下，可以适当用化痰止咳的药物，比如清宣止咳颗粒或者是止咳糖浆等，也可以用氨溴索或者是溴己新做一做雾化。扁桃体发炎发烧一定要明确致病因素，如果是革兰氏阳性菌感染，还需要选用敏感的抗生素来积极的控制炎症，一般是选用青霉素类或者是头孢类的消炎药物。如果是病毒感染所引发，可以选择抗病毒的药物来治疗。平时注意休息，多喝水，可以吃具有清热解毒、清咽润喉作用的食物。