1、溃疡型肠结核：肠壁的集合淋巴组织和孤立淋巴滤泡首先受累，呈现出肠壁的充血和水肿，进一步发展为干酪样坏死，并形成边缘不规则、深浅不一的溃疡。
2、增生型肠结核：病变多局限在回盲部，黏膜下层及浆膜层可有大量结核肉芽肿和纤维组织增生，使局部肠壁增厚、僵硬，亦可见瘤样肿块突入肠腔。
3、混合型肠结核：兼有上述两种病变。