临床上绝大部分脂肪肝是通过体检时发现的，这类人群往往无任何临床症状。还有少部分人因肝区闷痛和胀痛主动到医疗机构就诊，被诊断为脂肪肝。还有长期超量饮酒导致酒精性肝硬化，这类人群往往同时伴有脂肪肝。
诊断脂肪肝临床最常用的方法有肝脏彩超检查、肝脏CT检查，还有部分医疗机构拥有肝脏瞬时弹性测定设备，这种检查更能准确反映脂肪肝的轻重程度，能够为临床治疗脂肪肝提供更为详尽的数量化临床依据。还有肝脏活组织检查，更能明确诊断脂肪肝的轻重程度，但由于是有创操作，副作用较多，临床上接受程度非常差，不作为常规脂肪肝的诊断方法。