腘窝囊肿，一般是一种非化脓性的、炎症性的病变，多见于类风湿关节炎或者骨关节炎。对于并不很明显的或者症状并不严重的腘窝囊肿，可以采取一些局部热敷、热疗的方法，或者局部注射糖皮质激素来进行局部的封闭治疗，都有一定的疗效。
另外，也要积极的治疗原发病。如果是关节腘窝囊肿比较明显，而且出现局部的压迫症状导致活动明显受限，或者疼痛非常严重，需要通过外科手术进行处理。大多数患者经手术后也会取得很好的疗效，当然还是要积极的治疗原发病，预防其复发，因此要定期随诊。