甲状腺恶性肿瘤严重程度与病理分型和分期以及患者的自身情况都有关系，恶性的甲状腺肿瘤，包括甲状腺的乳头状癌、滤泡状癌、髓样癌以及未分化癌。
其中甲状腺乳头状癌最多见，乳头状癌它的分化程度最高，预后最好。
甲状腺乳头状态它分化好，生长缓慢，恶性程度低，预后较好。
滤泡状癌发展快，中等恶性，具有血管侵犯的倾向，预后不如乳头状癌。
髓癌是恶性肿瘤的中等，有颈部淋巴结转移和血行转移。
最后一个是未分化癌，它最恶，发展迅速，恶性程度高，常经血液向远处转移，预后很差。
此外预后还要跟甲状腺的分期有关系，根据TNM分期可以分为1、2、3期及4期，1期的预后最好，十年的生存率为97%-100%。4期预后最差，十年生存率40%-60%。
此外还要结合患者自身的情况，年轻的患者一般预后良好，具体病变程度要结合患者个体情况进行综合判断。