上厕所肛门疼痛，可以选择口服止痛药物，萘普生、对乙酰氨基酚、西乐葆或者双氯芬酸钠等药物止痛。如果疼痛比较剧烈可以选择曲马多、泰勒宁或者选择阿片类的止痛剂。可以选择外用的止痛乳膏，比如双氯芬酸钠乳膏或者丁卡因等麻醉类的胶浆剂都可以用来止痛。可以选择消炎止痛的栓剂，比如萘普生栓或者消炎止痛栓，效果也都非常的好。上厕所肛门疼痛首先要明确到底是因为什么造成的疼痛，如果一味的单纯止痛可能会延误病情。