注射瘦肩针的主要副作用是其一般都具有时效性，瘦肩针注射的药物是注射用A型肉毒素，时效性为半年。失去了肉毒素的药物作用之后，瘦肩针注射的相应位置，会随着运动慢慢恢复到原来的样子，除此之外基本不会存在其他副作用，但是前提是求美者需要选择在正规的医疗机构注射瘦肩针。
一部分求美者会感觉瘦肩针注射之后上肢活动有无力的感觉，是由于注射瘦肩针的肩膀位置要配合着肩关节活动，因此注射瘦肩针之后，肌肉产生麻痹，自然会导致肩膀的活动尤其是上抬的时候，会明显出现力不从心的感觉。但是为了使瘦肩针达到好的效果，求美者需要接受且适应，适应后随着慢慢的肩膀瘦下来，求美者就可以看到自己颈背部美丽的线条了。