急性大三阳如果出现肝功能的异常，通过保肝治疗及抗病毒治疗能够恢复正常。但目前抗病毒药物并不能够清除血液当中的肝炎病毒，所以大部分急性大三阳肝炎的发作都会转为乙肝携带者，未来如果抵抗力下降，又会再次出现肝炎的发作。
如果反复发作，迁延不愈，就会出现肝纤维化、肝硬化，甚至肝癌。对于乙肝大三阳的携带者，需要每半年定期进行肝病的体检，体检的目的主要是随访是否有肝炎的发作，如果一旦出现肝炎的发作，就需要进行积极的抗病毒治疗。一线的抗病毒药物包括恩替卡韦及替诺福韦，能够有效抑制乙肝病毒的复制，延缓肝纤维化、肝硬化、肝癌的发生。