幼年特发性关节炎主要发生在关节，表现为关节疼痛，以及慢性炎症，治疗要进行终身或者长期治疗，不规范治疗就会引起骨质损害，导致残疾。幼年特发性关节炎分为全身型、少关节型、多关节型，根据不同类型治疗方案有差异，应当给予糖皮质激素的治疗，应用的剂量也不一样，还有免疫抑制剂，常用的包括甲氨蝶呤等，全身型的剂量也不一样。
在疾病的炎症期、急性期要注意卧床休息，同时给予高静脉、高营养的蛋白质摄入，以维持身体的免疫系统功能，同时要进行床上的功能锻炼，来维持关节活动度以及肌肉力量，防止肌肉萎缩。在日常生活中，不发生急性变化的时候，要进行适当的活动来维持关节的稳定、维持关节的功能。