睾丸扭转15-30分钟左右即可产生明显的疼痛感，随时间推移疼痛逐渐加重，到2小时左右疼痛达到顶峰，可以维持2-6小时左右，这时疼痛难以忍受需要立即到医院进行就诊。
因为症状与附睾炎症状类似，所以有时可认为是附睾炎，而耽搁相关的治疗。睾丸扭转一般发生在夜间，在睡眠中突然出现疼痛感，疼痛感进行性加重，外观上显示扭转侧睾丸位置抬高，用手上抬时疼痛可加重。
但是当发生附睾炎时炎症侧的睾丸是下垂状态，用手轻轻托起时疼痛可减轻，凭这一点可以进行鉴别，但最终确诊需要到医院进行精索及睾丸彩色多普勒超声检查达到确诊的目的，对于睾丸扭转一旦怀疑或者一旦确诊，需要立即进行手术复位治疗，以免造成睾丸缺血坏死。