囊性肿瘤的共同症状是体表或体内有肿状物即囊肿，或大或小，生长部位不同、内容物也不同。大多数无明显自觉症状或有轻微酸痛，有时有轻度压痛。多数病例有局部酸胀或不适，可影响活动。少数因生长部位特殊会有其他局部症状。
1、皮脂腺囊肿：肿物圆形，单个或多个，小者似豆大，大者直径可达数厘米。位于皮肤或皮下组织内，有时在皮脂腺口有一黑头粉刺样小栓，挤压可有白色豆腐渣样内容物。一般无其他不适，若继发感染时，可呈现红肿、压痛或化脓溃破。
2、皮样囊肿：易发生于眼睑之内或外眦部，增长缓慢，最大不超过核桃大小。囊肿表面光滑，不与表层的皮肤相粘连，有较大张力，有波动或面团样感。
3、表皮样囊肿：一侧面部麻木、疼痛或抽动、听力减退、进行性视力障碍、复视、发作性头痛、呕吐、意识不清、偏瘫、不太不稳、语言不清、癫痫发作等等。
4、腱鞘囊肿：腕背或足背缓慢发展的囊性肿物，圆球形，直径一般不超过2cm，表面光滑，边界清楚，质软，无明显自觉症状或轻微酸痛。