在花粉播散季节避免接触花粉是最理想的预防方法, 但在实际工作和生活中难以做到, 所以大多数花粉症患者还要依靠药物治疗。花粉症的治疗应分发作期治疗和缓解期治疗。
一、一般治疗
1、去除诱因  ：了解存在的诱因并及时消除，如避免接触花粉等过敏原。
2、合并症的治疗：如有急性哮喘或呼吸困难，可用糖皮质激素或沙丁胺醇进行紧急处理。
二、药物治疗
1、抗组胺药物：是最常用的一类药物，如苯海拉明、西替利嗪、氯雷他定。大多能有效地控制花粉症的急性鼻、眼症状, 但不能抑制病情的发展。
2、麻黄碱滴鼻剂：一种减充血剂，可快速有效地疏通鼻堵。注意此类药物一般不要连续使用一周以上。
3、糖皮质激素：局部应用糖皮质激素鼻喷剂是目前推荐的治疗花粉症的最佳方案。由于局部用药, 效果良好, 全身吸收很少, 所以激素的副反应显著减轻。对于中重度的花粉症的患者, 应用抗组胺药及局部用糖皮质激素不能很好地缓解症状时, 需要全身注射长效糖皮质激素。
4、白三烯受体拮抗剂：如孟鲁司特钠，能阻断白三烯引起的鼻部炎症。由于鼻腔局部用糖皮质激素不能抑制白三烯的释放，所以白三烯受体拮抗剂与糖皮质激素有协同作用，可以减少激素用量，从而减轻激素带来的副作用。
5、变应原浸液：此法为变应原特异性免疫治疗（AIT），已证实是唯一有可能改变过敏性疾病自然进程的治疗方法。简而言之，即在明确致病变应原后，使用该变应原浸液通过不同途径，以逐渐递增剂量的方式导入体内，并最终使人体耐受高于自然暴露剂量的维持治疗剂量，经过AIT后，机体免疫系统发生改变，使机体在处于相对低剂量变应原的自然暴露环境时，仅有轻微症状甚至无症状。
三、手术治疗
花粉症无手术治疗。
四、中医治疗
如敏康片(主要成分为灵芝、虫草菌丝体等)，可以调整花粉症患者相关基因表达，改善患者过敏体质，缓解临床症状。但必须注意的是，传统中药制剂和致敏花粉可能存在相同抗原性或交叉抗原性，花粉症患者应慎用传统中药制剂。
五、其他治疗
物理治疗：1、花粉阻隔剂：涂抹于鼻腔，可有效控制花粉症相关的过敏性鼻炎症状。
2、鼻腔冲洗：从国内外临床应用经验看，鼻腔冲洗虽然并不具备直接抗炎作用，但是鼻腔冲洗与抗组胺药、鼻用糖皮质激素联用能增强药物疗效，减少药物使用量，可以作为安全、有效的补充治疗手段。