咳嗽伴有发烧的患者首先应该是到医院就诊，进行血常规、C反应蛋白以及胸部CT的检查，如果患者是刺激性干咳，一般还可以做支原体的抗体的检测。通过这些初步检查可以帮助分辨是病毒、细菌，还是支原体的感染，然后再针对病因采取有针对性的治疗措施。
如果患者是来自有病毒流行的地区，一般医生会结合患者的流行病学史，再根据患者的临床表现以及初步实验室检查，帮助判断是否具有传染性病毒性肺炎，或其他病原体引起的肺炎。如果患者没有明确接触到新型冠状病毒，或者其他具有传染性病原体的流行病学史，多数情况下还是常见的普通的病毒、细菌或者支原体感染。