巨阙穴位于上腹部前正中线，前正中线就是人体的任脉，肚脐上六寸的位置就是巨阙穴。将四个手指并拢，四个手指并拢时过中指的近端指间关节，就是中指两条指间关节的横线。患者面对手掌时会发现有两条横线，靠近身体这侧的是近端指间关节，靠近中指指甲远端的叫远端指间关节。所以四指并拢，在中指的近端指间关节，以这一条为基础线画一条横线，跨过四指距离，就是人体的三寸，所以再从脐的位置往上六寸，就是巨阙穴。
巨阙穴是任脉上非常重要的一个穴位，一般治疗胃肠相关疾病比较有效，同时也可以治疗部分胸痛、心痛等疾病，最主要还是胃肠功能失调用巨阙穴治疗相对多些。