嘴上起疱疹属于病毒感染性疾病，在外搽药物方面可以选择中药或者西药的治疗。
中药方面包括中药湿敷，其主要的组成成分是黄连、黄柏、黄芩、鲜马齿苋、金银花、连翘、紫花地丁、蒲公英，煎水冷湿敷患处一天两次，一次20分钟或者应用甘草油，就是用新鲜的甘草在芝麻油里干炸10分钟，把油滤出、晾凉再用无菌的纱布蘸取药液敷于患处。
在西医方面可以涂抹阿昔洛韦软膏，或者更昔洛韦软膏进行抗病毒治疗，如果出现破溃还需要联合涂抹复方多粘菌素B软膏，或者夫西地酸软膏等抗细菌感染的药膏，预防相应的细菌感染。